Бывший работник студии анимационных фильмов Генри получает приглашение посетить свой рабочий кабинет. Когда он приходит, то видит только пустующие комнаты, в одной из которых находится чернильная машина.
В «Бенди и Чернильная Машина», он решает запустить этот агрегат в работу, но для этого ему нужно отыскать в мастерской шесть элементов. Запуск аппарата приводит в движение чернильного монстра, который нападает на мультипликатора. Чудом ему удаётся избежать гнева разбушевавшегося Бенди, посредством падения в подземное хранилище. Теперь в «Bendy and the Ink Machine» перед ним стоит множество загадок, решение которых может привести к спасению.