Черепашки Ниндзя уже давно наделены призванием защищать положительных героев, и наказывать отрицательных персонажей. Они никогда не сидят без работы, выполняя определённые миссии в разных уголках планеты.
Сейчас ваши персонажи прибыли на место своей дислокации, и обнаружили, что нет нигде их учителя Сплинтера. Скорее всего, к этому приложили свои грязные лапы агрессивные мутанты, которых появилось много в городе. Нельзя мешкать ни минуты, жизнь их наставника под угрозой. Смелые защитники вместе отправляются на поединок с жестокими врагами.